При упаковке работающего Py-кода с миграциями alembic возникает множество проблем, с ходу погуглив которые — не решить:
Для нормальной компиляции в Venv и вывода проблем при запуске бинарника — необходимо запускать Pyinstaller модулем прям там:
./venv/bin/python3 -m PyInstaller -d bootloader [other args]
«Can't find Python file env.py» лечится добавлением папки миграций к бинарнику --add-data — файлы распаковываются в /tmp/ вместе с остальными исполняемыми файлами (https://ru.stackoverflow.com/questions/1360697/%D0%9A%D0%B0%D0%BA-%D0%B4%D0%BE%D0%B1%D0%B0%D0%B2%D0%B8%D1%82%D1%8C-%D0%BD%D0%B5%D1%81%D0%BA%D0%BE%D0%BB%D1%8C%D0%BA%D0%BE-%D1%84%D0%B0%D0%B9%D0%BB%D0%BE%D0%B2-%D0%BA-exe-add-data)
env.py должен быть совместимым с целевой ОС: «No module named 'logging.config'» при запуске собранного бинарника — не лечится добавлением --hidden-import, но лечится закомменчиванием строк fileConfig() в env.py и добавлением опций из alembic.ini в скрипт: alembic_cfg.set_main_option(…)
«Warning When using programmatic configuration, make sure the env.py file in use is compatible with the target configuration; including that the call to Python logging.fileConfig() is omitted if the programmatic configuration doesn’t actually include logging directives.»
(WARNING at https://alembic.sqlalchemy.org/en/latest/api/config.html)
Пути в скрипте миграций должны иметь явное указание или на директорию, откуда запускается бинарник, или на /tmp/_MEI…, второе можно сделать с sys._MEIPASS (https://stackoverflow.com/questions/51060894/adding-a-data-file-in-pyinstaller-using-the-onefile-option , example)
«Path ... is not represented in current version locations» чинится указанием:
alembic_cfg.set_main_option('script_location','relative/folder')
alembic_cfg.set_main_option('version_locations','same as script_location param[/subdir]')
